Multe minuni s-au revărsat până astăzi asupra celor care cu credinţă au venit să se închine Sfântului Ioan cel Nou, minuni amintite parţial şi de mitropolitul Kievului, Sfântul Petru Movilă. Dintre ele remarcam pe aceea de la 2 iunie 1622, când cetatea a fost apărată de pârjolitoarea năvălire a cazacilor zaporojeni. Iată ce scrie acest sfânt ierarh:
"În anul 1629 lună august 3 zile, venind în mănăstirea Pecersca Varlaam ieromonachul, din pământul Moldovei, şi fiind trimis la mine ca să mă vadă de cătră Miron Barnovschi Voievodul, mi-a spus, ca în anul 1622 când necuratul împărat al agarenilor, Sultanul Osman, a venit sub Hotin, ca să se bată cu regatul Poloniei...
Cazacii zaporojeni, care mergeau în contra necuraţilor, nu s-au dus numai la Hotin, unde era şi oastea poloneză, ci s-au îndreptat spre oraşul Suceava, ca să-l prade pe el... În timp ce năvălitorii se îndreptau spre oraş, localnicii Sucevei se retrăgeau cum se obişnuia în cetate.
Fiind atunci mitropolit Anastasie Crimca cu preoţii au voit, după obiceiu, să ducă din mitropolie în cetatea de sus şi moaştele Sfântului Ioan cel Nou, şi când au venit, ca să le ia, n-au putut să le ridice de la locul lor (căci acestea totdeauna cu darul lui Dumnezeu, când la nevoie oraşul trebuia să fie mântuit de inamicii, ce cădeau asupra lui). Cu aceasta au făcut cunoscut mântuirea lui (oraşului), că nu va fi nici cu armele, nici cu lupta, dar la rugăciune şi ajunare au alergat toată mulţimea, ce fugise în cetate, rugând pe Dumnezeu şi pe Sfântul Ioan, plăcutul lui, pentru mântuire.
Iar când au venit cazacii la rău şi cum voiaua intra şi în oraş, o minune! râul, pre care oamenii îl treceau în sus şi în jos, deodată aşa s-a umplut cu apă, că nici odată mai nainte n-a fost aşa de inundat. Iar ei văzând aceasta s-au spăimântat şi au început a se retrage; şi aşa oraşul s-a mântuit cu rugacinile Sfântului Ioan martiriul cel Nou.
Şi de la acel timp mitopolitul cu tot clerul şi cu episcopii au stabilit, că acea zi să se serbeze... fac în mitropolie în acea zi litie, înconjurând biserica cu moaştele Sfântului Ioan, şi mulţumind lui Dumnezeu, cel ce cu cinste i-a mântuit pe dânşii de aşa nenorocire cu rugăciunile Sfântului marelui martir Ioan cel Nou."